在造舰上取得共识之后，朱由检当即下令：
“海军要尽快制定十年造舰计划，把各项准备做好。”
“之前朕让海洋研究院舰船研究所设计标准船型，现在进展如何？”
海洋研究院设在海军学堂，之前是海军护军使喻安性在管。
听到皇帝询问，喻安性道：
“臣已让人整理宝船、战船、马船、粮船、水船等船型，选择最好的船只做标准。”
“只是争议还比较多，暂时没定下来。”
大明的船只和火炮一样，都存在种类太多的问题。
这在此时的人看来，不觉得是什么大问题。甚至还觉得不同的船只和火炮，能适应更多的场景。
但是在朱由检这个经历过工业时代的人看来，那就实在太乱了。
所以他宁肯抛弃很多火炮种类，降低火炮对各种场景的适应性，只选择几种作为制式火炮，方便制造训练。
如今面对舰船，他也是如此打算：
“以后海军的舰船，不要分得这么细。”
“按用途分为战船和运输船即可，在运输船的基础上，衍生出货船、兵船、马船、粮船、水船等种类。”
“海军的运输船，要能作为武装商船，必要时加装火炮，用于海上作战。”
“这种船只，还可以对外售卖，并且向获得许可的海商，贩卖火炮和火铳等武器。”
喻安性听到这里，急忙道：
“臣以为这样不妥！”
“海商若能够武装，会更难以管教。”
“臣恐一些人为祸，在海上兼做海贼。”
朱由检摆了摆手，说道：
“事情没那么严重！”
“海军部加强管理即可。”
“可以每隔年颁发一次许可证，只允许获得许可的商船武装。”
“而且这些船只，要在规定的港口停靠，不许随意跑动。”
“朕的打算，是以这些武装商船作为预备役，不服役的时候收取免役钱。”
“若是朝廷和敌人交战，舰船不足的时候，可以征调商船，用于运输甚至上阵。”
“武装商船的水手，也都划入预备役，有在遇到战争时服役的责任。”
“海军的水手、水兵将来退役后，海军部也要介绍他们加入武装商船，加强对这些商船的管理。”
这是寓兵于民的举措，袁可立听到之后，赞同道：
“此策堪称极妙！”
“海军不必在平时的时候，养着许多运输船。”
俞咨皋等人，同样也赞同这个举措。
就这样，海军部又多了一个武装商船管理的责任。
朱由检在海军部设立动员司，专门负责海军预备人员的培养和动员。
对于预备役船舶，他打算设立船级社管理：
“海军舰船研究所，要制定各种舰船的标准，对一百吨以上的海船定级。”
“所有一百吨以上的海船，在制造时都要遵守一定的规范，方便海军征用时，统一进行管理。”